Les comptes annuels de la Fondation sont audités tous les ans. Les rapports financiers sont déposés sur le RCS et publiés sur le site de la Fondation. Les dons reçus dans le cadre des activités de lutte contre les violences sexuelles ont été transférés à l’a.s.b.l. Stand Speak Rise Up après sa création. 

La gestion financière de la Fondation du Grand-Duc et de la Grande-Duchesse est actuellement confiée à la Fiduciaire Générale de Luxembourg (Deloitte) et la vérification des comptes est effectuée par KPMG.